Le lac est d'origine glacière et repose sur une mystérieuse légende : Saint-Pierre et Jésus, en voyage dans la région habillés comme des pauvres gens, ont demandé l'hospitalité aux habitants de Barbazan. Repoussés par ceux-ci, mais accueillis dans une demeure située en dehors du village, par un couple de condition modeste, ils punirent les habitants de leur inhospitalité. Saint-Pierre et Jésus entrouvrirent alors la terre d’où jaillit l’eau qui engloutit le village et donna naissance au lac de Barbazan. En dehors de cette légende et outre le fait que son système d'alimentation ne soit pas connu, le lac de Barbazan constitue un cas rare de lac glacière à cette altitude (450 m).